Die Phantomdiebe feiern ihren Sieg über Kaneshiro bei einem Feuerwerksfest. Doch die Freude hält nicht lange an, denn die internationale Hackergruppe Medjed hat es auf die Streiter für die Gerechtigkeit abgesehen. Daraufhin wird Akira von einer mysteriösen Person namens Alibaba kontaktiert, welche seine ...
Nachdem auch Makotos Persona erwacht ist, wird sie von den Phantomdieben zur Strategin der Gruppe auserkoren. Gemeinsam infiltrieren sie Kaneshiros Gedankenpalast und müssen dabei feststellen, dass dieser seinen Schatz durch einen gigantischen Safe gesichert hat. Nun kommt es auf das neue Teammitglied ...
Nach dem Fernsehauftritt von Akechi überlegen die Phantomdiebe, wie sie der Welt ihre Gerechtigkeit besser nahebringen können. Da meldet sich die Journalistin Ichiko Ohya und versucht, mit ihnen Kontakt aufzunehmen. Makoto bekommt unterdessen in der Schule Hinweise darauf, dass Schüler in Straftaten ...
Madarame eröffnet Yusuke die tragische Wahrheit über die „Sayuri“. In Wahrheit handelt es sich um ein Selbstporträt von Yusukes Mutter, die Madarame eiskalt hat sterben lassen. Es kommt zum großen Kampf zwischen dem Kunstfälscher und den Phantomdieben. Doch Madarame hat noch ein paar schmutzige Tricks ...
Auf der Phan-Site verdichten sich die Hinweise, dass Madarame seinen Ruhm mit kriminellen Methoden erschlichen hat. Akira, Ryuji und Ann versuchen, aus Madarames Schüler Yusuke mehr Informationen herauszubekommen und besuchen ihn zu Hause. Doch als Morgana sich ins Innere des Hauses schleicht, bekommt ...
Ryuji und Akira erfahren, dass sie bei Kamoshida nur einen Sinneswandel herbeiführen können, indem sie dessen Begierden in Form eines Schatzes aus seinem Palast stehlen. Doch um diesen zu materialisieren, müssen sie ihre Tat in der Wirklichkeit ankündigen. Denn nur auf diese Weise wird sein Unterbewusstsein ...
Eigentlich wollte Akira Kurusu nur einer Frau in Not helfen, doch stattdessen wird ihm eine Straftat angehängt, die er nie begangen hat. Als vorbestrafter Jugendlicher muss er an die Shujin-Akademie im Herzen Tokyos wechseln. Doch dort gehen seltsame Dinge vor sich, und schon bald findet er sich statt ...