Das große Finale im Kampf um den Heiligen Gral! Saber kämpft gegen Berserker und erkennt in ihm einen alten Bekannten, der längst verheilte Wunden wieder aufreißt. Währenddessen kämpfen Kirei und Kiritsugu um Leben und Tod.
Kirei ermordet Tokiomi und wird so zum neuen Master von Archer. Unterdessen versucht Waver im Wald, neue Kraft für Rider zu sammeln, nachdem dieser nach den vergangenen Kämpfen nur noch wenig Energie übrig hat. Zur gleichen Zeit wird Irisviel von Berserker überfallen und entführt.
Kiritsugu willigt ein, Kayneth und dessen Verlobte zu verschonen, wenn dieser seinen Servant zum Selbstmord zwingt. Doch der Auftragskiller spielt ein doppeltes Spiel. Saber verabscheut die mangelnde Moral und Ritterlichkeit ihres Masters und droht, die Verbindung zu lösen.
Ryunosuke ist erschüttert über die Zerstörung seines Stützpunktes, doch Caster hat bereits große Pläne, um seinen Master aufzuheitern. Unterdessen manipuliert Archer den nach einem Lebenssinn suchenden Kirei immer weiter, was schon bald drastische Konsequenzen nach sich zieht ...
Vor dem Schloss Einzbern haben sich Saber und Lancer verbündet, um Casters Unwesen ein Ende zu setzen. Zur gleichen Zeit liefern sich Kiritsugu und El-Melloi im Inneren des Anwesens ein gnadenloses Magierduell. Kirei versucht unterdessen, das Chaos auszunutzen um Irisviel auszuschalten, während Saber ...
Saber und Irisviel stecken auf dem Schlachtfeld in der Klemme, als Lancer von seinem Master den Befehl erhält, sich auf Berserkers Seite zu schlagen. Während sich zwischen den Parteien unerwartete Bündnisse bilden, beschwört der Serienmörder Ryunosuke Uryu den Servant Caster herbei. Gemeinsam schmieden ...
Der Gralskrieg – eine ultimative Schlacht auf Leben und Tod zwischen sieben Mastern, die mithilfe ihrer heraufbeschworenen Servants kämpfen, um den »Heiligen Gral« zu erringen. Nach mittlerweile drei ergebnislosen Kriegen betreten nun neue Charaktere den Schauplatz des Geschehens. Dabei hat jeder Master ...